Mapeamento antigênico da proteína NS1 de Flavivírus : uma abordagem in-silico.

Abstract

Atualmente, o número de doenças provocadas por Flavivirus é significativo. No ano de 2020 foram notificados 931.903 casos possíveis de infecções por Dengue virus (DENV) e 6.805 casos possíveis de infecções por Zika virus (ZIKV). Apesar do alto impacto causado por estes casos, pouco se sabe sobre as prováveis variações de proteínas entre as diversas linhagens circulantes no Brasil, o que pode ser um empecilho na criação de novas vacinas e testes. O alvo do estudo que se segue é a proteína NS1, uma vez que além de ter função na montagem da estrutura viral, está ligada a diversas funções na infecção como romper vasos sanguíneos e causar uma cascata de infecção celular através da ativação de enzimas do organismo presentes no glicocalix, tropismo determinado por células endoteliais e vazamento de vasos e células para o extravasamento do vírus. O trabalho consiste no alinhamento de sequências da NS1 correspondentes ao vírus DENV, ZIKV e YFV, com a finalidade de uma observação de regiões conservadas e polimórficas na proteína, bem como análise das variações intra e inter específicas entre os resíduos e predição de epítopos imunogênicos, o trabalho usou da bioinformática para obter grande parte das conclusões. As variações foram descritas, a proteína foi modelada IN-SiLICO através de programas computacionais, houve a predição de epítopos para células T e B e também foram feitas imagens de variações na superfície da NS1 para as espécies. Os resultados quanto à variabilidade da proteína foram interessantes, uma vez que houve o registro de diversas regiões polimórficas e não polimórficas em uma curta quantidade de resíduos, a similaridade entre a proteínas foi de 28,6%, enquanto a identidade foi de 50,6%. Houveram alterações na quantia de mutações e variabilidade entre as espécies de acordo com as regiões da proteína, o que pode ter ocorrido devido a exposição ao meio e a funcionalidade da mesma. A NS1 se mostrou antigênica e teve grande quantia de epítopos encontrados nos servidores de predição, sendo 96 epítopos para células T e 136 para células B. O trabalho poderá auxiliar no direcionamento da realização de novas vacinas e testes diagnósticos para o mercado.