Aplicação de target fishing na identificação de atividades biológicas de compostos da biblioteca virtual do Laboratório de Química Medicinal e Bioensaios da Universidade Federal de Ouro Preto.

Abstract

A modelagem molecular tem sido amplamente utilizada para identificar compostos bioativos. O docking ou ancoragem molecular permite prever a conformação de encaixe dos ligantes no sítio ativo de um receptor, levando em consideração as interações intermoleculares e a energia de ligação. Já a dinâmica molecular (DM) é um método baseado em simulações que prevê como cada átomo se moverá ao longo do tempo, com base em um modelo físico. Essas técnicas podem ser aplicadas no target fishing (TF), que avalia quais alvos moleculares têm os melhores encaixes para cada ligante, considerando princípios como o da similaridade estrutural. Este trabalho teve como objetivo a aplicação de target fishing na identificação de atividades biológicas de compostos presentes na biblioteca virtual do Laboratório de Química Medicinal e Bioensaios. Os alvos PKCα e PIM1 foram escolhidos para o estudo, com base nos resultados preliminares do SwissTargetPrediction. A interação dos ligantes com os alvos foi analisada por meio de docking molecular utilizando o software GOLD, seguida da dinâmica molecular no programa GROMACS. Os resultados indicaram que PKCα e PIM1 são alvos promissores pois várias moléculas, como ACCR004, EAMA007, EAMA019 e JMF033, demonstraram potencial para inibir essas proteínas, podendo ser direcionadas para o desenvolvimento de terapias contra o câncer. A análise dos resultados na PKCα demonstrou que ligantes mais flexíveis estabelecem interações mais fortes e estáveis com PKCα, enquanto ligantes mais rígidos mostraram menor estabilidade. Por outro lado, substituição de uma hidroxila fenólica por metoxila, pode levar a uma menor afinidade dos ligantes por exclusão estérica na PIM1. Ensaios biológicos deverão ser realizados em colaboração para confirmar as atividades biológicas previstas, validando experimentalmente os resultados desse trabalho.