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dc.contributor.advisorSilva, Breno de Mellopt_BR
dc.contributor.advisorGonçalves, Ricardo Lemespt_BR
dc.contributor.authorBatista, Ubiratan da Silva-
dc.date.accessioned2022-10-04T20:39:52Z-
dc.date.available2022-10-04T20:39:52Z-
dc.date.issued2022pt_BR
dc.identifier.citationBATISTA, Ubiratan da Silva. Triagem otimizada de epítopos consensuais do antígeno estrutural E2 de CHIKV e EEEV: uma abordagem in silico. 2022. 62 f. Monografia (Graduação em Bacharelado em Ciências Biológicas) - Instituto de Ciências Exatas e Biológicas, Universidade Federal de Ouro Preto, Ouro Preto, 2022.pt_BR
dc.identifier.urihttp://www.monografias.ufop.br/handle/35400000/4609-
dc.description.abstractNos últimos anos, a vacinologia reversa e a imunoinformática revolucionaram a construção de protótipos vacinais. Apesar dos avanços nas etapas de seleção de alvos imunogênicos, doenças virais importantes, como as causadas por Alphavirus, permanecem sem tratamentos ou vacinas licenciadas nas principais agências de saúde do mundo. No presente estudo, nós identificamos através de abordagens in sílico epítopos lineares e conservados das proteínas estruturais E2 dos Alphavirus Chikungunya virus (CHIKV) e Eastern equine encephalitis virus (EEEV). Para identificação dos epítopos foram utilizadas as predições das ferramentas: Bepipred 2.0 e Predicted Antigenic Peptides/IMED para células B, NetCTL para células T-citotóxicas e IEDB – Binding Predictions para células T-auxiliares. Para predição de conservação foi usada a ferramenta IEDB - Epitope Conservancy Analysis. Foram identificados 294 peptídeos preditamente antigênicos nas proteínas E2 destes vírus, sendo 71,20% para células T-auxiliares, 19,92% para células B e 8,87% para células T-citotóxicas. Com 60% de identidade mínima entre as sequências, a análise de conservação identificou 63 (21.50%) destes peptídeos como sendo conservados. Desconsiderando a redundância das sequências, 40 destes epítopos foram selecionados. Os epítopos conservados foram analisados na estrutura tridimensional e estão distribuídos entre os 3 domínios da proteína. A identificação dos alvos conservados entre Alphavirus artritogênicos e encefalitogênicos constituí importante via para o desenho otimizado de antígenos para plataformas vacinais. Além disso, a seleção otimizada destes epítopos pelas ferramentas POA1 e POA2, mostram que estas ferramentas podem ser usadas para identificação de peptídeos em múltiplas abordagens visando proteínas virais para o desenvolvimento de vacinas e testes diagnósticos.pt_BR
dc.language.isopt_BRpt_BR
dc.subjectVacinaspt_BR
dc.subjectMúltiplos-epítopospt_BR
dc.subjectEpítopos linearespt_BR
dc.subjectAlphaviruspt_BR
dc.subjectAntígenospt_BR
dc.titleTriagem otimizada de epítopos consensuais do antígeno estrutural E2 de CHIKV e EEEV : uma abordagem in silico.pt_BR
dc.typeTCC-Graduaçãopt_BR
dc.contributor.refereeSilva, Breno de Mellopt_BR
dc.contributor.refereeGonçalves, Ricardo Lemespt_BR
dc.contributor.refereeCarvalho, Lívia Mendespt_BR
dc.contributor.refereeÁvila, Ricardo Andrez Machado dept_BR
dc.description.abstractenIn recent years, reverse vaccinology and immunoinformatics have revolutionized the construction of vaccine prototypes. Despite advances in immunogenic targeting steps, relevant viral diseases, such as those caused by Alphavirus, remain without treatments or vaccines licensed by the world's leading health agencies. In the present study, we identified linear and conserved epitopes of the E2 structural proteins of Alphavirus Chikungunya virus (CHIKV) and Eastern equine encephalitis virus (EEEV) using in silico approaches. The screening of epitopes was carried out by the use of predictions tools: Bepipred 2.0 and Predicted Antigenic Peptides/IMED for B cells, NetCTL for T-cytotoxic cells and IEDB – Binding Predictions for T-helper cells. The tool IEDB - Epitope Conservancy Analysis was used for conservancy analysis. A total of 294 predicted antigenic peptides were identified in the E2 proteins of these viruses, 71.20% for T-helper cells, 19.92% for B cells and 8.87% for T-cytotoxic cells. With 60% minimal sequence identity, conservation analysis identified 63 (21.50%) of these peptides as being conserved. Disregarding sequence redundancy, 40 of these epitopes were considered. The conserved epitopes were analyzed in the three-dimensional structure and are distributed among the 3 domains of the protein. The identification of conserved targets between arthritogenic and encephalitogenic Alphaviruses constitutes an important route for the optimized design of antigens for vaccine platforms. Furthermore, the optimized selection of these epitopes by the POA1 and POA2 tools show that these tools can be used for peptide identification in multiple approaches targeting viral proteins for vaccine development and diagnostic tests.pt_BR
dc.contributor.authorID17.2.4072pt_BR
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